Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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