Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms