Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20830J3KML6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20830J3KML6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20830J3KML6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20830J3KML6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20830J3KML6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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