Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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