Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ighm-202ENSMUST00000177715 1698 ntAPPRIS P5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gucd1-202ENSMUST00000118936 2843 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Apex2-201ENSMUST00000026303 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tpd52l2-201ENSMUST00000000844 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms