Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3002E9PW72 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms