Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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