Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms