Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn6Q9Z262 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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