Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms