Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf25Q9QZR0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf25Q9QZR0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf25Q9QZR0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf25Q9QZR0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms