Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Pgpep1Q9ESW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms