Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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