Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms