Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pard3bQ9CSB4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms