Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Use1Q9CQ56 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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