Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ophn1Q99J31 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms