Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf144aQ925F3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms