Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
StradbQ8K4T3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms