Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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