Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Scnm1Q8K136 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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