Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Lrif1Q8CDD9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrif1Q8CDD9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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