Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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