Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vwc2Q8C8N3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms