Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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