Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ube3dQ8BX13 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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