Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms