Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrc1Q80VQ1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms