Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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