Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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