Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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