Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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