Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Cln3Q61124 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms