Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sin3aQ60520 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3aQ60520 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms