Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggnbp2Q5SV77 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms