Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms