Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syne3Q4FZC9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Syne3Q4FZC9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syne3Q4FZC9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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