Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Obox3Q3UT54 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Obox3Q3UT54 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms