Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fchsd2Q3USJ8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms