Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll12Q3UDE2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms