Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
YrdcQ3U5F4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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