Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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