Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms