Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hace1Q3U0D9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms