Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms