Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cntnap5cQ0V8T7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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