Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
AmbpQ07456 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms