Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms