Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms