Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms